E11 Bio, en ideell forskningsorganisation som samarbetar med Francis Crick Institute, MIT och Max Planck Institute, meddelar att deras datamängd för hjärnvävnad nu är tillgänglig via AWS Registry of Open Data – Amazon Web Services register över offentligt tillgängliga datamängder.
Detta är ett viktigt steg för att kartlägga hur olika områden i hjärnan är sammankopplade och hur de kommunicerar med varandra – i forskningstermer kallat konnektom.
En ökad förståelse för hur hjärnan fungerar banar väg för nya behandlingar av neurologiska sjukdomar. Genom att tillgängliggöra datamängden via AWS hoppas man kunna göra det möjligt för fler att delta i neurovetenskaplig forskning.
Bild: Rekonstruktion av hippocampus hos en mus med E11 Bios PRISM-teknik. Fotocredt: Tyler Sloan.
AI är ett viktigt verktyg i kartläggningen, men problemet är att det är både kostsamt och tidskrävande att manuellt granska de nervcellsbanor som AI-system spårar. E11 Bio arbetar därför med att förbättra AI-baserad kartläggning och minska behovet av manuell granskning.
Metoden bakom heter PRISM (Protein-barcode Reconstruction by Iterative Staining with Molecular annotations), där varje enskild nervcell får en unik identitet, ungefär som en streckkod i affären.
Att på detta sätt koda varje cell underlättar för maskininlärningsalgoritmer och gör det möjligt att spåra nervceller med minimalt behov av manuell granskning.
Genom att göra datamängden tillgänglig via AWS kan fler forskare och organisationer bidra till en djupare förståelse för hur hjärnor hos däggdjurs är uppbyggda. Detta kan i sin tur bana väg för nya behandlingar av neurologiska sjukdomar.
Mer information finns här.
